Bakteriofag to wirus infekujący bakterie. Bakteriofagi, odkryte po raz pierwszy około 1915 r., odegrały wyjątkową rolę w biologii wirusowej. Są to prawdopodobnie najlepiej rozumiane wirusy, ale jednocześnie ich struktura może być niezwykle złożona. Bakteriofag jest zasadniczo wirusem składającym się z DNA lub RNA, który jest zamknięty w otoczce białka. Powłoka białkowa lub kapsyd chroni genom wirusowy. Niektóre bakteriofagi, takie jak bakteriofag T4, który infekuje E coli, mają również białkowy ogon złożony z włókien, które pomagają przyczepić wirusa do gospodarza. Zastosowanie bakteriofagów odegrało istotną rolę w wyjaśnieniu, że wirusy mają dwa podstawowe cykle życiowe: cykl lityczny i cykl lizogenny.
Wirusy, które zabijają zainfekowaną komórkę gospodarza, są uważane za zjadliwe. DNA w tego typu wirusach jest reprodukowane przez cykl lityczny. W tym cyklu bakteriofag przyczepia się do ściany komórkowej bakterii i wstrzykuje DNA do gospodarza. Wirusowy DNA replikuje się i kieruje budową i montażem bardziej wirusowego DNA i innych części wirusowych. Po zmontowaniu nowo wyprodukowane wirusy nadal rosną w liczbie i otwierają się lub ulegają lizie. Liza powoduje zniszczenie gospodarza. Cały cykl można ukończyć w ciągu 20-30 minut w zależności od różnych czynników, takich jak temperatura. Rozmnażanie fagów jest znacznie szybsze niż typowe rozmnażanie bakterii, więc całe kolonie bakterii można bardzo szybko zniszczyć. The
cykl lityczny jest również powszechny w wirusach zwierzęcych.Wirusy umiarkowane to te, które rozmnażają się bez zabijania swojej komórki gospodarza. Umiarkowane wirusy rozmnażają się przez cykl lizogeniczny i wejść w stan uśpienia. W cyklu lizogenicznym wirusowe DNA jest wstawiane do chromosomu bakteryjnego poprzez rekombinację genetyczną. Po wstawieniu genom wirusa jest znany jako profag. Kiedy bakteria gospodarza się rozmnaża, genom profagowania jest replikowany i przekazywany do każdej bakteryjnej komórki potomnej. Komórka gospodarz niosąca profagat ma potencjał do lizy, dlatego nazywa się ją komórką lizogenną. W stresujących warunkach lub innych wyzwalaczach profilowanie może przejść z cyklu lizogenicznego do cyklu litycznego w celu szybkiego rozmnażania cząstek wirusa. Powoduje to lizę komórki bakteryjnej. Wirusy infekujące zwierzęta mogą również rozmnażać się w cyklu lizogenicznym. Na przykład wirus opryszczki początkowo wchodzi w cykl lityczny po zakażeniu, a następnie przechodzi w cykl lizogeniczny. Wirus wkracza w okres utajony i może przebywać w tkankach układu nerwowego przez miesiące lub lata bez zjadliwości. Po uruchomieniu wirus wchodzi w cykl lityczny i wytwarza nowe wirusy.
Bakteriofagi mogą również wykazywać cykl życia nieco inny niż zarówno cykl lityczny, jak i lizogenny. W cyklu pseudolizogennym wirusowe DNA nie ulega replikacji (jak w cyklu litycznym) ani wstawianiu do genomu bakteryjnego (jak w cyklu lizogenicznym). Cykl ten zwykle występuje, gdy nie ma wystarczającej ilości składników odżywczych do utrzymania wzrost bakterii. Genom wirusowy staje się znany jako przedprofag który nie ulega replikacji w komórce bakteryjnej. Gdy poziomy składników odżywczych powrócą do wystarczającego stanu, pre-faga może albo wejść w cykl lityczny lub lizogenny.