Ewolucja to zmiana gatunku w czasie. Jednak po drodze ekosystemy pracując na Ziemi, wiele gatunków ma bliskie i ważne relacje ze sobą, aby zapewnić im przetrwanie. Te związki symbiotyczne, takie jak związek drapieżnik-ofiara, utrzymują prawidłową pracę biosfery i zapobiegają wyginięciu gatunków. Oznacza to, że ewolucja jednego gatunku wpłynie w jakiś sposób na inny gatunek. Ta koewolucja gatunku jest jak ewolucyjny wyścig zbrojeń nalega, aby inne gatunki w związku również ewoluowały, aby przetrwać.
Hipoteza „czerwonej królowej” w ewolucji jest związana ze koewolucją gatunków. Stwierdza, że gatunki muszą stale dostosowywać się i ewoluować, aby przekazywać geny następnemu pokoleniu, a także powstrzymać się przed wyginięciem, gdy ewoluują inne gatunki w relacji symbiotycznej. Ta część hipotezy, zaproponowana po raz pierwszy w 1973 roku przez Leigh Van Valena, jest szczególnie ważna w relacji drapieżnik-ofiara lub relacji pasożytniczej.
Źródła pożywienia są prawdopodobnie jednym z najważniejszych rodzajów relacji w odniesieniu do przetrwania gatunku. Na przykład, jeśli gatunek zdobyczy ewoluuje w miarę upływu czasu, drapieżnik musi się przystosować i ewoluować, aby nadal wykorzystywać zdobycz jako niezawodne źródło pożywienia. W przeciwnym razie szybsza zdobycz ucieknie, a drapieżnik straci źródło pożywienia i potencjalnie wyginie. Jeśli jednak drapieżnik sam stanie się szybszy lub ewoluuje w inny sposób, na przykład stając się cichszym lub lepszym myśliwym, związek może być kontynuowany, a drapieżniki przeżyją. Zgodnie z hipotezą Czerwonej Królowej ta ewolucja gatunku do przodu i do tyłu jest ciągłą zmianą z mniejszymi adaptacjami gromadzącymi się w długich okresach czasu.
Kolejna część hipotezy Czerwonej Królowej dotyczy selekcji seksualnej. Odnosi się do pierwszej części hipotezy jako mechanizmu przyspieszającego ewolucję o pożądanych cechach. Gatunki, które są w stanie wybrać partnera, a nie przejść rozmnażanie bezpłciowe lub brak możliwości wyboru partnera może zidentyfikować cechy tego partnera, które są pożądane i wytworzą bardziej odpowiednie potomstwo dla środowiska. Mamy nadzieję, że to mieszanie pożądanych cech doprowadzi do wyboru potomstwa naturalna selekcja i gatunek będzie kontynuowany. Jest to szczególnie pomocny mechanizm dla jednego gatunku w symbiotycznym związku, jeśli drugi gatunek nie może zostać poddany selekcji seksualnej.
Przykładem tego rodzaju interakcji może być związek żywiciel i pasożyt. Osoby, które chcą kojarzyć się w obszarze z licznymi pasożytniczymi związkami, mogą poszukiwać partnera, który wydaje się być odporny na pasożyta. Ponieważ większość pasożytów jest bezpłciowa lub nie jest zdolna do selekcji seksualnej, gatunek, który może wybrać partnera immunologicznego, ma przewagę ewolucyjną. Celem byłoby wytworzenie potomstwa, które ma cechę, która czyni je odpornymi na pasożyta. To sprawiłoby, że potomstwo byłoby bardziej odpowiednie dla środowiska i prawdopodobnie żyłoby wystarczająco długo, aby się rozmnażać i przekazywać geny.
Ta hipoteza nie oznacza, że pasożyt w tym przykładzie nie byłby w stanie koewoluować. Istnieje więcej sposobów gromadzenia adaptacji niż tylko seksualna selekcja partnerów. Mutacje DNA może również spowodować zmianę w pula genowa tylko przez przypadek. Wszystkie organizmy, niezależnie od stylu rozmnażania, mogą mieć mutacje w dowolnym momencie. Pozwala to wszystkim gatunkom, nawet pasożytom, na koegzystencję w miarę ewolucji innych gatunków w ich symbiotycznych związkach.