Pierwotnie sklasyfikowana jako proterosuchid (a zatem bliski krewny współczesnego Proterosuchusa), niedawna analiza pozwoliła Xilousuchusowi znaleźć się znacznie bliżej do korzenia drzewa genealogicznego archozaura (archozaury były rodziną wczesnych triasowych gadów, które dały początek dinozaurom, pterozaurom i krokodylom). Znaczenie Xilousuchusa polega na tym, że datuje się on na początek okresu triasu, około 250 milionów lat i wydaje się, że był to jeden z pierwszych krokodylich archozaurów, wskazówka, że te „rządzące jaszczurki” się oddzieliły w krokodyle prehistoryczne i przodkowie pierwsze dinozaury (a więc i pierwszych ptaków) znacznie wcześniej niż wcześniej sądzono. Nawiasem mówiąc, azjatycki Xilousuchus był blisko spokrewniony z innym pływającym archozaurem Ameryki Północnej, Arizonasaurusem.
Dlaczego Xilousuchus wielkości kota miał żagiel na plecach? Najbardziej prawdopodobne wytłumaczenie to selekcja seksualna; być może samce Xilousuchus z większymi żaglami były bardziej atrakcyjne dla kobiet w okresie godowym, a może żagiel oszukał drapieżników, myśląc, że Xilousuchus był większy niż był w rzeczywistości, tym samym oszczędzając go zjedzony. Biorąc jednak pod uwagę jego niewielki rozmiar, jest bardzo mało prawdopodobne, aby żagiel Ksilousucha pełnił jakąkolwiek funkcję regulacji umiarkowanej; jest to bardziej prawdopodobna hipoteza dla takich 500-funtowych gadów
Dimetrodon, który musiał szybko się rozgrzać w ciągu dnia i rozproszyć nadmiar ciepła w nocy. W każdym razie brak pływających krokodyli w późniejszym zapisie kopalnym sugeruje, że ta struktura nie była kluczowa dla przetrwania tej szeroko rozpowszechnionej rodziny.