Alchemik to powieść napisana w dwóch częściach i epilogu. Kręci się wokół andaluzyjskiego pasterza o imieniu Santiago i jego poszukiwań własnej osobistej legendy, która zabiera go ze swojej wioski do piramid w Egipcie. Podczas swoich podróży spotyka szereg postaci, które albo bezpośrednio mu pomagają, albo dają mu cenną lekcję poprzez przykład.
Melchizedek i alchemik zostają mentorami, a Anglik zapewnia i przykład tego, co się stanie, jeśli masz nadzieję zdobyć wiedza głównie z książek, a handlarz kryształami pokazuje mu życie, które prowadzi się, jeśli ktoś nie słucha Osobistości Legenda. Alchemik osadzona jest we wszechświecie, w którym każda istota ma swoją Osobistą Legendę, a świat ma duszę, która jest wspólna dla wszystkich, od żywych istot po szorstką materię.
Część pierwsza
Santiago jest młodym pasterzem z Andaluzji i cieszy się z nadchodzącej podróży do miasta, w którym był w poprzednim roku, ponieważ poznał dziewczynę, którą się zakochał. Jest córką kupca, który kupuje od niego wełnę, mężczyznę mającego problemy z zaufaniem, który domaga się, aby Santiago ściął przed nim swoje owce, aby uniknąć oszustwa. Śpi w opuszczonym kościele, w którym ma powtarzający się sen związany z widokiem piramid. Kiedy wyjaśnia to cygańskiej kobiecie, ona interpretuje to dość prosto, mówiąc, że rzeczywiście musi udać się do Egiptu, aby znaleźć zakopany skarb. Na początku waha się, ponieważ cieszy się życiem pasterza i musiał postępować wbrew woli rodziców, ponieważ chcieli, aby został kapłanem.
Następnie wpada na starca o imieniu Melchizedek, który wyjaśnia koncepcję „Legendy osobistej”, która jest osobistym spełnieniem, do którego wszyscy muszą dążyć. To jest „to, co zawsze chciałeś osiągnąć. Wszyscy, gdy są młodzi, wiedzą, jaka jest ich osobista legenda. ”Mówi mu, że musi słuchać wróżb, aby znaleźć swoją skarb, a on daje mu dwa magiczne kamienie, Urim i Tummim, które odpowiadają „tak” i „nie” na pytania, na które nie może znaleźć odpowiedzi samodzielnie.
Santiago udaje się do Tangeru po sprzedaży swoich owiec, ale gdy tam się znajduje, zostaje okradziony ze wszystkich pieniędzy przez człowieka, który powiedział mu, że może zabrać go do piramid. Nie przejmuje się tym zbytnio, ponieważ zaczyna pracować dla handlarza kryształami, wzmacniając biznes pracodawcy dzięki swoim sprytnym pomysłom. Kupiec kryształów miał kiedyś Osobistą Legendę - pielgrzymując do Mekki - ale zrezygnował z niej.
Część druga
Gdy Santiago zarobi wystarczająco dużo pieniędzy, nie jest pewien, co robić. Minęło jedenaście miesięcy i nie jest pewien, czy powinien wrócić do Andaluzji, by kupić owce za swoje zarobki, czy kontynuować swoją wyprawę. W końcu dołącza do karawany, aby udać się do piramid. Tam spotyka kolegę podróżnika, znanego jako Anglik, który uprawia alchemię. Udaje się do oazy Al-Fayoum, by spotkać się z alchemikiem, który ma nadzieję nauczyć się, jak zamienić dowolny metal w złoto. Podczas podróży po pustyni Santiago uczy się, jak skontaktować się z Duszą Świata.
Na pustyni toczy się wojna, więc karawana na razie pozostaje w oazie. Santiago postanawia pomóc Anglikowi znaleźć alchemika. Ich źródłem informacji jest Fatima, dziewczyna, którą spotyka, gdy zbiera wodę ze studni i w której natychmiast się zakochuje. Proponuje jej małżeństwo, a ona się zgadza, pod warunkiem, że ukończy swoje zadanie. Jest „pustynną kobietą”, która potrafi czytać znaki i wie, że wszyscy muszą wyjść, zanim wrócą.
Po wyjściu na pustynię Santiago ma wizję, dzięki uprzejmości dwóch jastrzębi atakujących się nawzajem, atakowanej oazy. Atakowanie oazy jest pogwałceniem zasad pustyni, więc odnosi to do wodzów, ale mówią, że będzie musiał zapłacić życiem, jeśli oaza nie zostanie zaatakowana. Wkrótce po tej wizji spotyka nieznajomego w czarnych strojach siedzącego na białym koniu, który objawia się jako alchemik.
Oaza zostaje zaatakowana, a dzięki ostrzeżeniu Santiago mieszkańcy są w stanie pokonać najeźdźców. Nie pozostaje to niezauważone przez alchemika, który z kolei decyduje się mentorem Santiago i pomóc mu dotrzeć do piramid. Jednak wkrótce zostają schwytani przez inną grupę wojowników na pustyni. Alchemik mówi Santiago, że aby kontynuować podróż, powinien stać się wiatrem.
Będąc coraz bardziej zaznajomiony z Duszą Świata, Santiago koncentruje się na pustyni i ostatecznie udaje mu się stać wiatrem. To przeraża porywaczy, którzy natychmiast uwalniają zarówno go, jak i alchemika.
Udają się do klasztoru, w którym alchemik zamienia ołów w złoto i dzieli je. Jego podróż kończy się tutaj, ponieważ musi wrócić do oazy, ale Santiago idzie dalej i ostatecznie dociera do piramid. Zaczyna kopać w miejscu, w którym marzył o znalezieniu swojego skarbu, ale wpadł w zasadzkę najeźdźców i ciężko pobił. Jeden z najeźdźców, pytając o to, co robi tam Santiago, szydzi z jego snu, wspominając o tym marzył o skarbie zakopanym w opuszczonym kościele w Hiszpanii i że nie był na tyle głupi, by ścigać to.
Epilog
To daje Santiago odpowiedź, której szukał. Po powrocie do kościoła w Hiszpanii szybko wykopuje skarb, pamięta, że ułamek tego jest u Cyganki i postanawia połączyć się z Fatimą.