Od Karol Darwin pierwszy wymyślił Teoria ewolucji i jego pomysł na naturalna selekcja, ewolucja był kontrowersyjny temat dla wielu ludzi. Podczas gdy zwolennicy teorii wskazują na pozornie niekończącą się górę dowód na ewolucję, krytycy wciąż zaprzeczają, że ewolucja jest naprawdę faktem. Jednym z najczęstszych argumentów przeciwko ewolucji jest to, że istnieje wiele luk lub „brakujących łączy” w obrębie zapis kopalny.
Te brakujące ogniwa byłyby tym, co naukowcy uważają za przejściowe skamieliny. Przejściowe skamieliny to pozostałości organizmu, który znalazł się między znaną wersją gatunku a obecnym gatunkiem. Podobno skamieliny przejściowe byłyby dowodem na ewolucję, ponieważ wykazywałyby formy pośrednie gatunku i zmieniły i akumulowały adaptacje w wolnym tempie.
Niestety, ponieważ zapis kopalny jest niepełny, brakuje wielu skamielin przejściowych, które mogłyby uciszyć krytyków ewolucji. Bez tego dowodu przeciwnicy teorii twierdzą, że te formy przejściowe nie mogły istnieć, a to oznacza, że ewolucja jest nieprawidłowa. Istnieją jednak inne sposoby wyjaśnienia braku niektórych przejściowych skamielin.
Jedno wyjaśnienie można znaleźć w sposobie tworzenia skamielin. Bardzo rzadko martwy organizm staje się skamieliną. Po pierwsze, organizm musi umrzeć we właściwym miejscu. Obszar ten musi mieć jakąś wodę z osadami, takimi jak błoto lub glina, albo organizm musi być zachowany w smole, bursztynie lub lodzie. Wtedy nawet jeśli jest w odpowiednim miejscu, nie ma gwarancji, że zostanie skamieniały. Potrzebne jest intensywne ciepło i ciśnienie przez bardzo długi czas, aby zamknąć organizm w skale osadowej, która ostatecznie stanie się kopalną. Ponadto tylko twarde części ciała, takie jak kości i zęby, sprzyjają przetrwaniu tego procesu, aby stać się kopalną.
Nawet jeśli zdarzy się, że skamielina organizmu przejściowego rzeczywiście się wydarzyła, skamielina ta może z czasem nie przetrwać zmian geologicznych na Ziemi. Skały są stale łamane, topione i zmieniane na różne rodzaje skał w cyklu skalnym. Obejmuje to wszelkie skały osadowe, które mogły mieć w sobie jednocześnie skamieliny.
Również warstwy skał są układane jeden na drugim. Prawo superpozycji stwierdza, że starsze warstwy skały znajdują się na dnie stosu, podczas gdy nowsze lub młodsze warstwy skał osadowych, które są nakładane przez siły zewnętrzne, takie jak wiatr i deszcz, znajdują się bliżej Top. Biorąc pod uwagę, że niektóre przejściowe skamieliny, które jeszcze nie zostały znalezione, mają miliony lat, być może jeszcze ich nie znaleziono. Przejściowe skamieliny wciąż mogą tam być, ale naukowcy po prostu nie wykopali się wystarczająco głęboko, aby się do nich dostać. Te przejściowe skamieliny można również znaleźć w obszarze, który nie został jeszcze zbadany i wykopany. Nadal istnieje możliwość, że ktoś odkryje te „brakujące ogniwa”, gdy paleontolodzy i archeolodzy odkryją więcej Ziemi.
Innym możliwym wyjaśnieniem braku przejściowych skamielin byłaby jedna z hipotez dotyczących szybkości ewolucji. Podczas gdy Darwin twierdził, że te adaptacje i mutacje zachodziły i rozwijały się powoli w procesie zwanym stopniowość, inni naukowcy wierzą w ideę dużych zmian, które zaszły nagle, lub interpunkcji równowagi. Jeśli poprawny wzór ewolucji jest punktową równowagą, wówczas nie byłoby organizmów przejściowych, które pozostawiałyby przejściowe skamieliny. Dlatego legendarny „brakujący link” nie istniałby, a ten argument przeciwko ewolucji nie byłby już aktualny.