Związek wapnia i fosforanu, który tworzy szkliwo zębów, jest zmodyfikowaną formą hydroksyapatytu, który jest podatny na działanie kwasów. Bakterie, które rozwijają się na cukrach znajdujących się w jamie ustnej, rozmnażają się na powierzchniach zębów i wytwarzają kwasy.
Mechaniczne szczotkowanie zębów usuwa te bakterie i spłukuje je, ale nie robi nic, aby zaradzić ciągłemu uszkodzeniu szkliwa w wyniku ekspozycji na kwas. Na szczęście ślina neutralizuje te kwasy, a zęby wykorzystują związki znajdujące się w ślinie w celu remineralizacji szkliwa. Tak więc, dopóki tempo demineralizacji i tempo remineralizacji pozostają w równowadze, zęby pozostają mocne i zdrowe.
Kiedy więcej minerałów jest traconych z zębów niż jest wymienianych, powstają próchnica lub ubytki. Fluor pomaga, wchodząc w interakcje z hydroksyapatytem, tworząc silniejszy związek, który jest mniej podatny na atak kwasu. Ponadto fluor remineralizuje uszkodzone szkliwo (chociaż nie może naprawić wnęki po jej utworzeniu). Istnieją pewne dowody, że fluor może hamować rozwój bakterii na zębach lub ograniczać ich zdolność do produkcji kwasu.
Nawet jeśli wyplujesz pastę do zębów i prawdopodobnie przepłukasz usta, na zębach pozostaje wystarczająca ilość fluoru oraz w ślinie, aby zapewnić ochronę przez pewien czas po umyciu zębów lub użyciu fluoru wypłukać.